No Linux, há dois ambiente gráficos principais: o Kde e o Gnome. Ambos possuem ferramentas gráficas para o gerenciamento de arquivos. Quem usa Kde está acostumado com o Konqueror, que tem suporte a abas, a divisão de janelas, a scp e ftp, como no print de tela abaixo, onde eu tenho aberto o ambiente de rede, um ftp e o meu diretório padrão, além de uma outra aba.
Quem usa Gnome provavelmente usa o Nautilus, que também tem suporte a rede e ftp, mas não a scp.
Independente do ambiente gráfico utilizado, você pode usar qualquer um dos gerenciadores de arquivos que quiser. Eu, por exemplo, uso Gnome, mas prefiro o Konqueror para administrar meus arquivos.
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